Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BFSP2Q13515 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BFSP2Q13515 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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