Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED1Q13445 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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