Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms