Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX1Q04741 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms