Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAE1P78406 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAE1P78406 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAE1P78406 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAE1P78406 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAE1P78406 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAE1P78406 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAE1P78406 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAE1P78406 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAE1P78406 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAE1P78406 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms