Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERVK_113P63121 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P63121 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms