Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IDH3AP50213 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IDH3AP50213 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms