Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VEGFBP49765 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms