Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSFP46459 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSFP46459 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSFP46459 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSFP46459 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSFP46459 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSFP46459 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSFP46459 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSFP46459 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSFP46459 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms