Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ETV4P43268 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV4P43268 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ETV4P43268 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ETV4P43268 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ETV4P43268 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ETV4P43268 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ETV4P43268 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ETV4P43268 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV4P43268 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV4P43268 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV4P43268 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV4P43268 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ETV4P43268 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms