Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDF5P43026 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDF5P43026 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF5P43026 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GDF5P43026 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDF5P43026 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF5P43026 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF5P43026 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms