Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP1P29466 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP1P29466 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP1P29466 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP1P29466 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms