Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms