Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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NFKB1P19838 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB1P19838 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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