Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB1P08034 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB1P08034 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB1P08034 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB1P08034 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB1P08034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB1P08034 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB1P08034 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB1P08034 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB1P08034 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms