Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLBP06746 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLBP06746 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLBP06746 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLBP06746 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLBP06746 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLBP06746 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLBP06746 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLBP06746 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLBP06746 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms