Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOA4P06727 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOA4P06727 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA4P06727 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOA4P06727 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOA4P06727 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOA4P06727 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOA4P06727 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms