Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALUO43852 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALUO43852 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALUO43852 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALUO43852 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALUO43852 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALUO43852 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALUO43852 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALUO43852 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALUO43852 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALUO43852 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALUO43852 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms