Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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