Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9JCJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9JCJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9JCJ5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms