Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PPA2-203ENST00000351450 1072 ntTSL 213.83□□□□□ -0.27e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.227e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-210ENST00000502833 842 ntTSL 312.29□□□□□ -0.447e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 CCDC57-211ENST00000578187 696 ntTSL 212.27□□□□□ -0.457e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 XBP1-206ENST00000484256 2173 ntTSL 211.92□□□□□ -0.57e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MITD1-205ENST00000438121 999 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.567e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MRPL33-204ENST00000472192 238 ntTSL 39.86□□□□□ -0.837e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MRPL33-203ENST00000448427 527 ntTSL 49.43□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 PPA2-214ENST00000506815 839 ntTSL 27.96□□□□□ -1.147e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 37.55□□□□□ -1.27e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 MCM3AP-205ENST00000479557 364 ntTSL 26.35□□□□□ -1.397e-7■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.653e-33■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 22.6□□□□□ -1.993e-33■□□□□ 9.2
EFTUD2Q15029 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 320.16■□□□□ 0.822e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SH3BP4-209ENST00000484097 612 ntTSL 218.4■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.093e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 24e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.754e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 424.97■■□□□ 1.594e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.534e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.414e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.333e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.294e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.274e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 322.89■■□□□ 1.253e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.24e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-204ENST00000525066 1545 ntTSL 522.15■■□□□ 1.144e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.034e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-205ENST00000454871 887 ntTSL 219.72■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-204ENST00000448175 848 ntTSL 519.28■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-203ENST00000416906 519 ntTSL 519.05■□□□□ 0.643e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DHX15-207ENST00000511553 532 ntTSL 419.03■□□□□ 0.643e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.393e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MTHFD1L-206ENST00000423867 524 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TMX1-202ENST00000555574 943 ntTSL 215.76■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DNM1-209ENST00000493925 728 ntTSL 315.68■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-217ENST00000599310 1123 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TMX1-203ENST00000556683 2117 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 EPC1-205ENST00000469059 591 ntTSL 515.29■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.043e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DHX15-210ENST00000513092 567 ntTSL 415.15■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 EPC1-208ENST00000480402 907 ntTSL 215.05■□□□□ -03e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.063e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PPOX-205ENST00000462977 1165 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PPOX-211ENST00000494216 892 ntTSL 314.63□□□□□ -0.073e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSMC5-219ENST00000584880 597 ntTSL 314.44□□□□□ -0.14e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HAUS8-207ENST00000598517 1055 ntTSL 514.22□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DOCK6-212ENST00000590680 1391 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 DOCK6-213ENST00000591750 3023 nt12.13□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PPOX-203ENST00000460611 514 ntTSL 311.63□□□□□ -0.553e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.564e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 RAD51-202ENST00000382643 1588 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.583e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-9■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-216ENST00000598278 603 ntTSL 311.4□□□□□ -0.583e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 PSMC5-207ENST00000580063 562 ntTSL 211.15□□□□□ -0.624e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 IK-205ENST00000508301 868 ntTSL 211.04□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-209ENST00000487803 2190 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-221ENST00000627144 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-208ENST00000431651 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.46□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AARS-202ENST00000564359 590 ntTSL 310.17□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 NSD3-204ENST00000525081 1581 ntTSL 210.17□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-211ENST00000593409 1757 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-207ENST00000481671 1126 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-204ENST00000461488 569 ntTSL 39.92□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-206ENST00000594509 479 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-208ENST00000487416 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-206ENST00000465250 1281 ntTSL 29.52□□□□□ -0.893e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 29.33□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-205ENST00000415798 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.27□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.954e-14■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 28.91□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 AC008764.4-204ENST00000595505 400 ntTSL 28.85□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-214ENST00000597711 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -13e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-220ENST00000602194 534 ntTSL 38.8□□□□□ -13e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-213ENST00000594662 1076 ntTSL 28.57□□□□□ -1.043e-6■□□□□ 9.1
EFTUD2Q15029 SMIM7-205ENST00000463051 602 ntTSL 38.39□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 9.1
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