Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.749e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.759e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 310.21□□□□□ -0.779e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.849e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITGA6-206ENST00000442250 3393 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.859e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SYMPK-217ENST00000601600 560 ntTSL 49.65□□□□□ -0.869e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-218ENST00000557344 671 ntTSL 29.45□□□□□ -0.99e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-214ENST00000619418 1872 ntTSL 29.4□□□□□ -0.99e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.919e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CLASRP-209ENST00000588016 967 ntTSL 29.35□□□□□ -0.919e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-210ENST00000613633 776 ntTSL 39.29□□□□□ -0.929e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 38.82□□□□□ -19e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.059e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.069e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 LARP4B-203ENST00000412411 432 ntTSL 38.09□□□□□ -1.119e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.219e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 37.51□□□□□ -1.219e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.379e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SLC35F5-206ENST00000459683 744 ntTSL 26.16□□□□□ -1.429e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.449e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 OGT-208ENST00000472270 689 ntTSL 25.97□□□□□ -1.459e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.469e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-209ENST00000612255 2027 ntTSL 25.74□□□□□ -1.499e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-207ENST00000452606 631 ntTSL 25.7□□□□□ -1.59e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-215ENST00000620209 3123 ntTSL 25.46□□□□□ -1.549e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-208ENST00000457131 555 ntTSL 25.15□□□□□ -1.599e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 DDX52-211ENST00000614307 3550 ntTSL 25.11□□□□□ -1.599e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 24.28□□□□□ -1.729e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SLC35F5-208ENST00000469314 628 ntTSL 33.01□□□□□ -1.939e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SLC35F5-204ENST00000420066 736 ntTSL 32.92□□□□□ -1.949e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 LPIN2-203ENST00000584294 936 ntTSL 318.33■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.797e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-202ENST00000396791 3824 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -17e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.47e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.817e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-208ENST00000508483 864 ntTSL 42.95□□□□□ -1.947e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.997e-10■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 NECAB3-216ENST00000498353 597 ntTSL 316.57■□□□□ 0.243e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PICK1-212ENST00000472724 555 ntTSL 513.67□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PICK1-215ENST00000494434 559 ntTSL 410.9□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PDCD5-205ENST00000586316 480 ntTSL 23.53□□□□□ -1.841e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 321.97■■□□□ 1.114e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.454e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 37.55□□□□□ -1.24e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 USP48-209ENST00000487880 524 ntTSL 34.59□□□□□ -1.674e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 LONP1-210ENST00000590511 722 ntTSL 323.25■■□□□ 1.312e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 LONP1-212ENST00000590728 591 ntTSL 423.03■■□□□ 1.282e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ATP1B3-204ENST00000466678 1708 ntTSL 314.19□□□□□ -0.145e-13■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.175e-13■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.165e-13■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 27.28□□□□□ -1.245e-13■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ATP1B3-206ENST00000482635 569 ntTSL 54.77□□□□□ -1.655e-13■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 MIB2-218ENST00000505370 809 ntTSL 222.29■■□□□ 1.167e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 318.97■□□□□ 0.637e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ADIPOR2-205ENST00000540974 480 ntTSL 313.99□□□□□ -0.177e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ADIPOR2-204ENST00000537545 484 ntTSL 37.79□□□□□ -1.167e-11■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PDE8A-210ENST00000559086 538 ntTSL 416.08■□□□□ 0.165e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PDE8A-209ENST00000558543 644 ntTSL 33.82□□□□□ -1.82e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PDE8A-206ENST00000557819 575 ntTSL 43.17□□□□□ -1.95e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PDE8A-207ENST00000557954 586 ntTSL 42.79□□□□□ -1.965e-9■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.383e-12■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.47e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PXDC1-201ENST00000380277 1538 ntTSL 314.89□□□□□ -0.034e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.43e-12■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-12■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 TUBG2-202ENST00000588870 1776 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.031e-8■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 TUBG2-203ENST00000590396 856 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.381e-8■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-206ENST00000617243 2340 ntTSL 516.82■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-207ENST00000618794 2553 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.287e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.74■□□□□ 0.277e-7■□□□□ 9.5
EFTUD2Q15029 HGD-203ENST00000470321 528 ntTSL 37.72□□□□□ -1.176e-23■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 FARP1-213ENST00000595380 616 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-24■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 57.52□□□□□ -1.211e-24■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.115e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.75e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.65e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 518.21■□□□□ 0.515e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.435e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-210ENST00000421683 834 ntTSL 39.72□□□□□ -0.855e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 UCHL5-209ENST00000420791 1329 ntTSL 52.58□□□□□ -25e-9■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 RSRC2-205ENST00000524399 625 ntTSL 22.91□□□□□ -1.943e-21■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-208ENST00000554843 655 ntTSL 214.66□□□□□ -0.061e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-206ENST00000554541 925 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-13■□□□□ 9.4
EFTUD2Q15029 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-13■□□□□ 9.4
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