Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms