Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK1Q9UPV9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK1Q9UPV9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms