Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms