Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf109Q9NX04 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf109Q9NX04 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms