Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXD4L1Q9NU39 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms