Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SAR1AQ9NR31 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms