Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPRD1BQ9NQG5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms