Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRPEL1Q9HAV7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRPEL1Q9HAV7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRPEL1Q9HAV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms