Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4CQ9C0C4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms