Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF25Q9BQ70 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms