Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNIP1Q8TF40 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNIP1Q8TF40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms