Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 211.62□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.584e-10■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-15■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 UBE2D2-203ENST00000398734 901 ntTSL 56.67□□□□□ -1.341e-15■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 35.9
PUM2Q8TB72 CD59-207ENST00000525763 789 ntTSL 39.51□□□□□ -0.896e-9■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 CD59-214ENST00000534312 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.896e-9■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 CD59-209ENST00000527926 633 ntTSL 38.22□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 CD59-212ENST00000533181 424 ntTSL 55.53□□□□□ -1.526e-9■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 TANK-210ENST00000437623 1702 ntTSL 54.15□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.031e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 KLF13-204ENST00000558673 447 ntTSL 36.07□□□□□ -1.441e-20■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 35.8
PUM2Q8TB72 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.293e-18■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.975e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.755e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.295e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.395e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.525e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.555e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.565e-20■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-10■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 35.7
PUM2Q8TB72 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 KREMEN1-206ENST00000479755 503 ntTSL 411.25□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 SLC25A12-205ENST00000472070 1889 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 SLC25A12-201ENST00000263812 2429 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 516.7■□□□□ 0.266e-16■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 215.94■□□□□ 0.146e-16■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MIIP-204ENST00000478299 595 ntTSL 214.73□□□□□ -0.056e-16■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MIIP-202ENST00000460823 955 ntTSL 514.51□□□□□ -0.096e-16■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-16■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 NOC4L-203ENST00000538784 862 ntTSL 218.89■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-12■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC11.62□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 35.6
PUM2Q8TB72 SYDE2-201ENST00000234668 3000 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.014e-11■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 221.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-25■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.495e-25■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.495e-25■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.685e-25■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-214ENST00000487632 2015 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-204ENST00000433381 1573 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-211ENST00000476064 1643 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-212ENST00000479512 1905 ntTSL 513.71□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-213ENST00000480296 2512 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-208ENST00000461020 2229 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-203ENST00000429366 1364 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-209ENST00000467294 3113 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-207ENST00000451194 1747 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 NPRL2-216ENST00000493465 462 ntTSL 37.23□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 35.66□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 SHTN1-206ENST00000497044 3647 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 35.5
PUM2Q8TB72 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.687e-23■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 29.24□□□□□ -0.937e-23■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.581e-323■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-323■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-10■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 ITM2B-204ENST00000607866 596 ntTSL 36.21□□□□□ -1.425e-10■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.348e-13■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 512.16□□□□□ -0.468e-13■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 IVNS1ABP-206ENST00000475046 1816 ntTSL 25.13□□□□□ -1.598e-13■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)3.81□□□□□ -1.88e-13■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 35.4
PUM2Q8TB72 TMOD3-211ENST00000561438 1139 ntTSL 57.86□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 35.4
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 281.3 ms