Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L2Q8NAA4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms