Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms