Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FAM71DQ8N9W8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71DQ8N9W8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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FAM71DQ8N9W8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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FAM71DQ8N9W8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM71DQ8N9W8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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