Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC43Q8N309 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms