Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDKL3Q8IVW4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms