Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF13Q86YI8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms