Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM17Q86X19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms