Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPH3Q86UC2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPH3Q86UC2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms