Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL17Q6UXB2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL17Q6UXB2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL17Q6UXB2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms