Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHISA2Q6UWI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHISA2Q6UWI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms