Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms