Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms