Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA3BQ502W6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms