Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP13A4Q4VNC1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms