Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HIST2H2ACQ16777 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIST2H2ACQ16777 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms