Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP1B1Q16678 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms